L’INJEP a pour mission d’analyser la situation des jeunes et des politiques de jeunesse, la vie associative et l’éducation populaire à tous les niveaux territoriaux. L’INJEP élabore et conduit des études et des recherches aussi bien quantitatives que qualitatives. Les travaux sont restitués dans des revues de recherche, telles Agora débats/jeunesse, des rapports et articles ainsi que sur les supports en ligne de l’institut.